Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms