Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd1A2AKB4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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