Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms