Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb4A2A863 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms