Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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