Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Top3bQ9Z321 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top3bQ9Z321 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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