Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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Hdac6Q9Z2V5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac6Q9Z2V5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Hdac6Q9Z2V5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Hdac6Q9Z2V5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Hdac6Q9Z2V5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Hdac6Q9Z2V5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Hdac6Q9Z2V5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Hdac6Q9Z2V5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Hdac6Q9Z2V5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms