Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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