Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms