Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek4Q9Z1J2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms