Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skp2Q9Z0Z3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms