Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms