Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc1Q9QZF2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms