Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dkk3Q9QUN9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms