Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd2l2Q9JLG4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms