Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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