Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ube3bQ9ES34 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube3bQ9ES34 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ube3bQ9ES34 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms