Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms