Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clstn1Q9EPL2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms