Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms