Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms