Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Tmem239Q9DA47 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem239Q9DA47 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem239Q9DA47 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem239Q9DA47 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem239Q9DA47 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem239Q9DA47 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem239Q9DA47 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem239Q9DA47 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tmem239Q9DA47 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tmem239Q9DA47 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tmem239Q9DA47 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem239Q9DA47 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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