Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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