Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms