Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX2

Cep89, Centrosomal protein of 89 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep89Q9CZX2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep89Q9CZX2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep89Q9CZX2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms