Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CYI0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms