Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms