Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms