Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn6Q99PL6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms