Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms