Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms