Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms