Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms