Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms