Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms