Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms