Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms