Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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