Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ercc8Q8CFD5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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