Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms