Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms