Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6G0

Ifi27, Interferon, alpha-inducible protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27Q8C6G0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ifi27Q8C6G0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ifi27Q8C6G0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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