Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp38Q8BW70 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp38Q8BW70 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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