Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Triml1Q8BVP1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Triml1Q8BVP1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms