Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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