Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms