Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ChfrQ810L3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ChfrQ810L3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ChfrQ810L3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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ChfrQ810L3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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