Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp8Q80U87 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp8Q80U87 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp8Q80U87 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp8Q80U87 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp8Q80U87 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp8Q80U87 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp8Q80U87 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp8Q80U87 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp8Q80U87 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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