Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NischQ80TM9 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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