Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms